Home

artirm's Journal

Recent Entries

You are viewing the most recent 25 entries.

25th November 2009

11:16am: Начальник подкатился узнать что я буду делать со своими идеями. Типа науку ты бросаешь, зачем они тебе. Прав, в общем-то. Идеи тока больно хороши. Пара простых, которые точно получаться. И пара действительно нетривиальных штук. Могут и не получиться, там сразу видать несколько проблем, но уж если получиться, то это PNAS. Я думаю так – простые штуки пусть делает, там и так любой догадается. А вот интересные штуки если хочет делать – то я в соавторах и in the loop, пока идет работа. Посмотрим на чем мы сторгуемся. Деваться ему в общем-то некуда. Идеи написаны в моем К99 проекте, проект отослан в NIH. Если из лэба начальника выйдет работа похожая на мой проект, NIH по головке не погладит. На всякий случай, краткий пересказ проектов.

Есть пептид, про который верят, что он аккумулируется в закисленных тканях (почти правда). Пептид пробуют применить для картинкования рака. Состоит из двух заряженных сегментов, отвечающих за растворимость, и одного трансмембранного, ответственного за аккумулирование. Две идеи:

1)
Меняем заряженные сегменты на ПЕГи – растет стабильность ин виво, меньше липнет к альбумину.
2)
Лепим несколько пептидов на дендример. Рассмотрим функцию (cell-bound agent)/(agent in solution) = F(pH). График этой функции - сигмоида. Несложные расчеты показывают, что для нашего дендримера график сильно круче чем для для мономерного агента. Отношение F(6.5)/F(7.4), для мономера ~5, а для дендримера с 7 пептидами ~1000. Т.е. imaging agent based on this technology, даст гораздо лучше контраст.

Вообще, есть пептиды, существующие в равновесии между раствором и трансмембранной формой. Их можно применить для построения двух интересных агентов:
3)
“Радиометка” – “такой пептид” – “субстрат для рецептор-тирозин киназы”. Штуковина плавает в крови и иногода вставляется в мембрану, потом уходит и выводится через почки. Если рецептор-тирозинкиназа гиперактивна (рак), то она фосфорилирует свой субстрат и наша кнструкция gets stuck it the membrane and accumulates in tumor. Никто еще не выдумал PET agent for direct measurement of a tyrosin kinase activity. And I can’t even start telling you how cool it would be.
4)
“Кусок ответственный за растворимость” – “субстрат для матрикс металлопротеазы” – “радиометка” – “такой пептид”
Если ММР гиперактивна (рак), то она режет свой субстрат, конструкция теряет растворимость и оседает там, где ММР геперактивана. Нетронутая молекула выводится через почки. Похожие идеи пробовали, но моя сильно лучше по ряду причин.

5) Применить идею с силильной защитой тройной связи для блочного click-synthesis сложных биоконьюгатов. Жалко, но это очень скоро кто-нибудь еще догадается сделать.

24th November 2009

10:26am: Мотивация – это наше все!
Ну на хрена мне писать эти гребаные статьи? Я еще только на пару недель ученый, а там - катись вся эта мышиная возня к чертовой бабушке.
Я уже и журнал выбрал какой попроще, и текст у меня почти весь в гранте и так был, и картинок рисовать не надо, и эксперимент я уже два месяца не делаю, а все равно – ломает. Если бы я хоть секунду верил, что мне это надо – работы бы было на два дня. А так я эти сопли жую уже три недели.
Ну да ничего, если эти друзья к 10 числу визу сделают – то и катись это все в тар-тарары. Надоело.

23rd November 2009

9:25am: В нашем “the best cancer center in the nation”(ТМ) я уже три недели не могу сделать HighRes MS. Уроды! Единственный (!) прибор на весь центр! (Это у нас тут, на секундочку сам Данишевский сидит.) И этот прибор даун примерно две недели из трех. Я не расист, но когда опреатор говорит с китайским акцентом, это приговор. Ладно, даун так даун, пишу в главную MS facility, мол не могли бы вы. Ответ, бкуквально: “What is HRMS? Anyway, find me in the lab to submit samples.” Окей, я ее нашел, она говорит – все сделаем. Через два дня выдает плохо откалиброванные MALDI спектры, примерно на 2 единицы офф. И зараяжает по 100 грин за образец.
Блядь! СТО! БАКСОВ! За спектр! Я эти спектры десятками снимал в Пенне. Брал пластинку и делал штук по двадцать за раз, когда нужда была. И занимало это минут по пять на колодец.

27th January 2009

2:06pm: Начальник задал сварить 35-аминокислотный пептид и хитро его функционализовать на N-конце. Через две недели он спрашивает, типа как так не готово?!

К чему бы это?...

30th December 2008

12:44pm: Достижения:
Lehningers Principles of Biochemistry - все с большой буквы, потому как больше года взяло.
C++ in 21 days - ну не 21 день, но где-то за полгода осилил.
5.9 trad, WI4 trad - не стабильно, но могу, если припрет.
полумарафон - никогда раньше не пробовал. Надо будет полный пробежать.
мыши, клетки - моими стараниями у шести мышей теперь будет рак, а я его буду изучать.

Публикации:
JOrgC, ChemPhysChem, JPhysChem, JPorphPhtal - два раза первым автором. Один из них случайно.

Приобретения:
машина - первая в жизни
ноутбук - наконец-то свой личный, а не конторский, по принципу правой ладони.
rock rack - почти полный
штормовка, штормовые штаны, пуховка - в сумме в два раза дороже машины.

Путешествия:
Katahdin, MN - это было круто. -20 и ветер, лидером на ключе. 4а, я бы сказал.
Washington, DC - ну, надо было отметиться.
Florida, Virginia, New Hampshire, бесчисленные даки и кэты

Да, а еще у меня новая работа. На Манхэттэне :-)

19th November 2008

12:00pm: Writing a grant proposal I suddenly discovered that there are no people doing actual research in America. Let's leave aside graduate students, who are barely considered living beings, but even as a postdoc, and I'm not considered a researcher. I'm a trainee, scholar, not yet scientist. Then, if everything is Ok, I'll be an assistant professor, and nobody expects professor to do any research - his business is to write grants and teach students. So, there is no way you can be doing research in academia. But, frankly, there is not many opportunities to do research in industry either.

16th October 2008

9:12am: British people
I happen to know four British people. Two of them are combustible mixture of ignorance and arrogance. You know, it seems like statistically significant result.

10th July 2008

11:34am: Рубикон перейден
- Работа, работа, работа.. целыми днями и без выходных...
- И давно ты так?
- Завтра начинаю...

14th September 2007

7:26pm: Краткий список мест, посещенных за последний месяц (8 Августа - 12 Сентября):

Сначала Штаты:

Сан-Франциско
Национальный Парк "Кинг Каньон"
Национальный Парк "Секвоя" включая Маунт Уитни (~4500 м)
Моно Лэйк

Потом Европа

Мюнхен
Нюренберг
Дрезден
Гамбург
Тулуза
Париж

Потом снова Штаты:

Провиденс
Бостон

4 раза долгий поезд, 7 флайтов, около 1000 миль на машине, 150 км под рюкзаком
По-моему, неплохо :-)

13th June 2007

3:41pm:

create your own visited countries map
or vertaling Duits Nederlands


Есть куда развиваться, но и успехи заметны.

14th February 2007

2:11pm: Nordic back-country skiing
А кто из вас, дорогие любители лыжного туризма, сам делал тросиковые крепления?

18th November 2006

12:49pm: Простые вещи
"Он говорил, что кофе состоит из кофе, варенья и табачного дыма..."
"Выпить утром чашку кофе и не закурить?! Тогда и просыпаться незачем!"

26th October 2006

1:39pm: A my zalezly na Half Dome po Snake Dike!

16th October 2006

8:02pm: "Modern Times" 5.8+; trad leading - с отвисами, но вылез. Хорошо штаны были коричневые.

20th September 2006

1:13am: Обычно это случалось на Комсомольской площади, в здании центральных железнодорожных касс. Теперь я это понял, увидев пришедшее по мэйлу подтверждение, суть не меняется.
МЫ ЕДЕМ В ГОРЫ!

1 NW # 150 21OCT PHILADELPHIA - MINNEAPOLIS ST PL 225P 419P
2 NW # 435 21OCT MINNEAPOLIS ST PL - SAN FRANCISCO 522P 722P

Yosemite, потерпи, я прибуду на днях!

6th September 2006

11:12am: У Жени на кухне увидел карту Индии. Индия это, конечно да, но больше меня заинтеровал Бутан, который в силу своих размеров и положения чисто случайно целиком поместился на эту карту. Так вот, поверхностный обзор интернета наводит на мысль, что все, кто об этой стране пишет старательно переписывают какие-то рекомендованные брошюры для иностранцев. Столько меда с сахаром в таких неожиданных местах, что диву даешься. Только квота на посещение иностранцами - несколько тысяч человек в год.

2nd September 2006

6:36pm: Лет уже порядком назад... )
5:43pm: Опять я у них европеец
Тренер на скалодроме:

- Я знаю что в Европе все так страхуют, но на моем скалодроме don't do that!

31st August 2006

10:41am: Докатился...
Коллега-китаянка входит утром в лэб и протягивает мне банку рыбных консервов. Мол, бери, не стесняйся...

29th August 2006

11:23am: Вот если я скажу, что люблю свой народ, люблю ни за что, а просто по тому что это мой (задумывается какой конкретно народ он supposed to любить, ну, пусть для общности будет) советский народ, ведь никто не скажет мне худого слова. Всякий порядочный человек любит cвой народ. И если я в Москве выйду на митинг и скажу, что всем нам надо любить наш советский народ, меня, конечно, сочтут несколько старомодным и черезчур простодушным, но посмотрят этак снисходительно-одобрительно. Мол, чего уж там, надо иногда вот так вот простые истины, которые с молоком, а то и правда забываем, простоват парень, конечно, но зато от души... Ну и все такое.
А теперь я выду на митинг и скажу, что не люблю негров, потому что они негры. И всем нам надо не любить негров. Меня, натурально, в кутузку. И без всякой там снисходительности, а по всей строгости уголовного кодекса.
Внимание, вопрос: почему любить по национальному признаку можно, а не любить нельзя?

UPD: Ах, эти французы, такие милые!
Азеры достали!
Чуете о чем я?

28th August 2006

10:05am: Вот тут другой умный человек высказался.
По вопросу вызвавшему дискуссию
Те же, только в профиль )

27th August 2006

2:45pm: "Зато у моего народа - какие глаза! Они постоянно навыкате, но - никакого напряжения в них. Полное отсутствие всякого смысла - но зато какая мощь! (какая духовная мощь!) эти глаза не продадут. Ничего не продадут и ничего не купят. Что бы не случилось с моей страной, во дни сомнений, во дни тягостных раздумий, в годину любых испытаний и бедствий - эти глаза не сморгнут. Им все божья роса..."

Так вот, Ерофеев - гений. В этой цитате все самые важные впечатления от поездки в Рашу.

12th August 2006

11:51pm: А адреналин-то, оказывается, жутко addictive.
10:47pm: Хибины вспомнились.
"И падали два башмачка со стуком на пол..." И десять часов у свечки. И мотявочки на креплениях. И лыжи у груди. И пила порвавшаяся. И волчьи лежки. И снежная доска на перевале. И лыжи из-под ног. И брезентовая тесемка зашитая тонкой стальной проволокой.
Это я так, что бы самому не забыть. Попробывал написать - ни фига не вышло. А не знает никто. Не было там никого.
Powered by LiveJournal.com

Advertisement